北陵鸢尾叶绿体基因组及其特征分析

摘要：

本研究为探究北陵鸢尾(Iris typhifolia)叶绿体基因组的基本特征,明确其在鸢尾属的系统发育位置,采用Illumina二代测序技术对北陵鸢尾叶绿体基因组进行测序,对其叶绿体基因组基本特征进行分析,结果表明:北陵鸢尾叶绿体基因组大小为 152 405 bp,具有典型的环状四分体结构,包含 82 335 bp的大单拷贝区(LSC)、18 018 bp的小单拷贝区(SSC)和一对 26 026 bp的反向重复区(IRs),总GC含量为 38.04%;共注释得到 133 个基因,包含 87个蛋白编码基因、8 个 rRNA基因和 38 个 tRNA基因;共检测到 57 个 SSR 位点,其中单核苷酸重复数量最多;系统发育分析表明北陵鸢尾和溪荪(I.sanguinea)关系较近,支持率为 100%.本研究通过对北陵鸢尾叶绿体基因组重复序列、IR边界、系统发育等进行分析,为北陵鸢尾的分子标记开发、系统发育分析、物种鉴定和种质资源开发及利用提供依据.

关键词：北陵鸢尾、鸢尾属、叶绿体基因组、高通量测序、简单重复序列、系统发育

所属期刊栏目：31

分类号：S945.79(水产保护学)

资助基金：中国野生湿生鸢尾种质资源收集、保存与评价研究;沈阳农业大学优秀本科毕业论文设计培育计划项目

在线出版日期：2023-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1656-1664