10.11733/j.issn.1007-0435.2023.04.005
紫花苜蓿R2R3-MYB亚家族鉴定与干旱胁迫下的表达分析
MYB(v-myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)家族是最大的转录因子家族之一,R2R3-MYB 亚家族在植物胁迫响应、次级代谢、生长和发育等过程发挥重要作用.本研究利用紫花苜蓿(Medicago sativa'Zhong-mu No.1')基因组和转录组数据,通过生物信息学方法鉴定了 R2R3-MYB转录因子,并对其序列特征、系统进化、染色体分布、基因结构、顺式作用元件及干旱胁迫下的表达模式进行分析.结果显示,紫花苜蓿中有121个R2R3-MYB亚家族成员,各成员均具有两个典型的MYB结构域,理化性质变化较大.系统进化分析将121个成员分为33个组,各成员无规律地定位在8条染色体上.基因结构和顺式作用元件分析发现,同一分组具有相同或相似的外显子数和顺式作用元件.响应干旱胁迫表达模式分析和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果表明干旱胁迫下MsMYB12,MsMYB45,MsMYB52,MsMYB73,MsMYB88,MsMYB124,MsMYB149,MsMYB189,MsMYB268 基因的表达量显著上调,可作为后期紫花苜蓿响应干旱胁迫机制研究的潜在靶点.
紫花苜蓿、R2R3-MYB、生物信息学分析、干旱胁迫、表达模式
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S772.3+6(森林工程、林业机械)
国家自然科学基金;国家自然科学基金;山西省中央引导地方科技发展资金项目;山西省基础研究计划青年科学研究项目;山西省高等学校科技创新项目
2023-05-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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