胡杨AHL基因家族生物信息学分析及逆境胁迫下的表达特征

摘要：

AT-hook核定位(AT-hook motif nuclear localized,AHL)蛋白作为一种小型DNA结合蛋白,广泛存在于植物中,在植物生长发育、逆境胁迫和激素信号应答等方面发挥着重要的作用.为全面了解胡杨(Populus euphratica)AHL基因家族的结构及功能,利用生物信息学方法及qRT-PCR对胡杨AHL家族成员的理化性质、基因结构、亚细胞定位以及逆境胁迫下的表达特征进行分析.理化性质分析表明,胡杨AHL家族共有19个成员,除PeAHL16外,其余PeAHL蛋白均为碱性的不稳定亲水蛋白.基因结构分析表明,PeAHL成员全部为内含子缺失型基因.系统进化结果显示,胡杨AHL家族成员可根据基因类型分为8个亚群.保守基序分析显示,聚类在同一分支中的PeAHL基因其motif组成及排列顺序基本相同.在顺式作用元件分析中,响应干旱胁迫的元件其种类和数量最多.实时荧光定量分析表明,PeAHLs的表达受低温、高温、NaCl以及PEG的显著诱导,与对照相比,PeAHLs在PEG处理下表达量最高.本研究结果为胡杨AHL基因家族的深入研究提供理论依据,为进一步解析胡杨AHL基因参与非生物逆境胁迫的分子机制提供参考.

关键词：AHL基因家族、胡杨、生物信息学、qRT-PCR

所属期刊栏目：31

分类号：Q344+.13(遗传学分支学科)

资助基金：国家自然科学基金;甘肃农业大学青年导师扶持基金,红砂响应盐胁迫的生理特性及耐盐分子机理的研究;对发展中国家常规性科技援助项目;红砂、白刺抗旱优良种质繁育技术示范与推广,中央财政林业科技推广示范资金资助

在线出版日期：2023-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：741-750