千穗谷TALE转录因子家族的生物信息学分析

摘要：

TALE转录因子广泛存在于植物中,对植物的生长发育和对外界环境的响应发挥着重要作用.本研究在千穗谷(Amnaranthus hypochondriacus)基因组中共鉴定出11个TALE基因.系统发育分析将千穗谷TALE家族蛋白分为BELL和KNOX两个亚家族,同一亚家族中的AhTALEs基因具有相似的基因结构,编码蛋白也具有类似的结构域.蛋白二级结构和三级结构分析都表明AhTALEs蛋白由螺旋-角-螺旋的结构构成.此外,对千穗谷与其他物种的TALE基因共线性关系、组织表达特性和AhTALEs基因启动子区的顺式作用元件分析发现,不同AhTALEs亚家族在各组织中的表达模式不同,并且发现启动子区包含大量非生物胁迫和激素响应元件,这为AhTALE家族的进化分析提供了依据.qRT-PCR分析发现AhTALEs基因在低温和干旱胁迫下的表达水平有不同程度的变化,表明AhTALEs基因能够响应低温和干旱胁迫应答.本研究为开展千穗谷中TALE转录因子在非生物胁迫中的生物学功能研究提供了重要参考.

关键词：千穗谷、TALE、基因家族、低温、干旱

所属期刊栏目：31

分类号：S344.13(耕作学与有机农业)

资助基金：山东省重点研发计划;中国科学院战略性先导科技专项;湖南省教厅项目

在线出版日期：2023-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：676-687