蒙古冰草ERF转录因子生物信息学及其表达分析

摘要：

ERF(Ethylene responsive factor)家族是植物中一种重要的转录因子,参与植物生长发育和逆境胁迫响应.为筛选蒙古冰草(A gropyron mongolicum Keng)抗旱相关的ERF转录因子,本研究利用生物信息学方法对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、进化关系及其二、三级结构进行分析,同时对不同干旱处理下的ERF基因进行表达分析.结果显示:筛选得到18个具有ERF结构特征的蒙古冰草ERF转录因子,蛋白大小在70～404 aa之间,分子质量在7447.54～43654.9之间,理论等电点(PI)在4.53～11.10之间,其中有2个疏水性蛋白,其余均为亲水性蛋白,大部分定位于细胞核.ERF转录因子的二、三级结构以无规则卷曲为主,推测motif1,motif2,motif3为保守基序.进化关系比对发现AmERF053,AmERF1B,AmERF4-1,AmERF4-2与已知具有抗旱功能的蛋白具有较高同源性,且在干旱处理的蒙古冰草中显著差异表达.

关键词：蒙古冰草、ERF转录因子、抗旱、生物信息学分析

所属期刊栏目：30

分类号：S543+.9(饲料作物、牧草)

资助基金：国家自然科学基金;内蒙古自治区草原英才创新团队资助

在线出版日期：2022-12-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：2910-2921