栽培金鸡菊EST-SSR分子标记开发与亲缘关系分析

摘要：

为了开发适用于栽培金鸡菊的EST-SSR分子标记,采用二代高通量测序技术对剑叶金鸡菊'斯丹泰勒'(Coreopsis lanceolata 'Sterntaler')的叶片进行转录组测序.结果表明:通过转录组测序共得到42958条Unigene,利用MISA软件共检测出个6546个SSR位点,平均分布距离6.36 kb.除单核苷酸外,重复类型以二核苷酸和三核苷酸为主,分别占总数的19.28％和30.13％,二者优势重复单元和占比分别为AG/CT(57.30％)和AAT/ATT(27.94％).通过Primer3软件设计得到4499条引物,在随机筛选的50对引物中成功开发出22对多态性较好的引物,扩增出的166个条带全部具有多态性.通过UPGMA聚类分析,在遗传距离为0.460时可将100个栽培金鸡菊种质划分为7类,其遗传相似系数介于0.5422～1之间,平均为0.7476.金鸡菊组、两色组、歧序组和轮叶组相关的种质可作为金鸡菊远缘杂交育种的材料.本研究为栽培金鸡菊的分类鉴定、杂交育种和绘制指纹图谱提供了理论依据.

关键词：金鸡菊、种质资源、EST-SSR、转录组、亲缘关系

所属期刊栏目：30

分类号：S32(作物品种与种质资源（品种资源）)

资助基金：河北省重点研发计划项目;现代种业科技创新专项

在线出版日期：2022-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1430-1440