10.11733/j.issn.1007-0435.2021.09.027
菊苣EST-SSR分子标记开发及通用性分析
为了开发菊苣(Cichorium intybus)简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)分子标记,采用菊苣表达序列标签(Expressed sequence tags,EST)序列设计EST-SSR引物,并验证引物的有效性和通用性.结果表明:菊苣EST序列中共搜索到648个SSR位点,146种重复基序,SSR出现频率为1.61%;三核苷酸重复类型最多(46.45%),TC/GA基序出现频率最高(14.35%);152对EST-SSR引物在菊苣中的有效扩增率和多态率分别为78.29% 和57.24%.其中37对引物在31份莴苣亚族(L actucinae Less.)材料中的扩增转移率为86.05%,遗传多样性分析显示不同种间存在明显的遗传分化,聚类结果与材料的地理来源有较高相关性.综上所述,基于菊苣EST序列开发的SSR引物可用于菊苣及其近缘属种遗传多样性分析及种间鉴定,为菊苣族(L actuceae Cass.)种质资源评价、系统进化研究及分子标记辅助育种奠定了重要基础.
菊苣;EST-SSR分子标记;信息分析;遗传多样性;通用性
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Q37(植物遗传学)
四川省科技计划项目;四川省现代畜牧业发展类项目
2021-10-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共10页
2081-2090