青海沙地白刺根际解淀粉芽孢杆菌DGL1的牧草促生活性及其基因组分析

摘要：

本研究测定了分离自青海大格勒干旱沙地白刺(Nitraria tangutorum)根围的解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)DGL1的生物学活性,并对菌株DGL1进行全基因组测序拼接分析.结果表明:通过平板对峙法测定菌株拮抗瓜类枯萎病菌(Fusarium oxysporum)、锐顶镰孢病菌(Fusarium acuminatum)、小麦赤霉病菌(Fu-sarium graminearum)活性,发现DGL1对3种病原真菌均具拮抗活性(抑菌圈平均直径均＞26 mm);采用羧甲基纤维素钠培养基测定菌株降解纤维素活性,发现菌株具有一定的降解纤维素活性;改良阿须贝(Ashby)无氮培养基检测证明菌株有固氮活性.对菌株促高原牧草燕麦(Avena sativa)、冷地早熟禾(Poa crymophila)、紫羊茅(Festu-ca rubra)、中华羊茅(Festuca sinensis)生长活性进行分析,发现DGL1具有促进4种牧草种子萌发和幼苗生长的能力;采用二代测序平台Illumina Hiseq×10对菌株DGL1进行全基因组测序拼接分析,表明菌株DGL1基因组DNA 全长3 915 550 bp,GC 含量为46.47％,CDS 数量为3 972,有86个 tRNA,27个 rRNA,与 COG,GO,KEGG数据库比对分别注释到2 970,2 926,2 160个功能基因.本研究结合生物特性与基因组分析对菌株DGL1进行了促生和抑菌相关功能基因预测,为其促牧草生长提供了理论依据.

关键词：极端生境、解淀粉芽孢杆菌、拮抗、促生、纤维素降解活性、全基因组测序

所属期刊栏目：29

分类号：S476(各种防治方法)

资助基金：青海省科技厅国际科技合作专项;青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室自主课题项目;青海省高寒草地适应性管理重点实验室;国家自然科学基金项目

在线出版日期：2021-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1637-1648