白三叶HD-Zip类转录因子TrATHB-12的克隆及表达分析

摘要：

HD-Zip转录因子是高等植物中特有的一类转录因子,在高等植物的生长发育以及生物和非生物胁迫等逆境应答中起着重要的调控作用.本试验以白三叶品种'拉丁诺'(Trifolium repens'Ladino')为试验材料,通过同源获取和cDNA末端快速扩增技术(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)得到白三叶HD-Zip类转录因子TrATHB-12全长序列,并利用相关软件分析其生物信息学特性,使用荧光定量的方法研究其对非生物胁迫、信号分子和激素的响应,从而为后续构建载体转染白三叶以研究其在各种胁迫下的响应提供一定的基础.试验结果表明,TrATHB-12全长cDNA为1175 bp,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)包括744个核苷酸序列,编码248个氨基酸,有2个保守结构域,仅包含HD和LZ,属于HD-Zip I类转录因子.同源分析和进化树结果显示,TrATHB-12基因核苷酸和蛋白质序列与其他豆科植物相似度较高,是较为保守的基因.生物信息学分析发现T rA T H B-12编码的蛋白理论分子量为28738,等电点为5.18,无信号肽和跨膜结构,是不稳定亲水蛋白.表达模式结果显示,TrATHB-12基因在根系和叶片中的表达量有所差异.其中,干旱可以显著诱导叶片中TrATHB-12基因的表达,盐胁迫则可以显著诱导根系中TrATHB-12基因的表达,TrATHB-12对其他逆境均有不同程度的响应;脱落酸(Abscisic acid,ABA)和吲哚乙酸(Indole acetic acid,IAA)处理下叶片中TrATHB-12的表达量显著上升;TrATHB-12对于H2O2和NO信号分子有较明显的响应.综上,本试验可为继续深入研究TrATHB-12基因,从而提高白三叶抗逆性奠定一定的基础.

关键词：白三叶、HD-Zip、基因克隆、生物信息学、表达模式

所属期刊栏目：28

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：四川省国际合作项目;现代农业产业技术体系四川饲草创新团队建设专项资金共同资助

在线出版日期：2020-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：319-327