苜蓿多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白2(MsPGIP2)基因多态性分析

摘要：

本研究旨在分离苜蓿多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白2(MsPGIP2)基因的基因组序列全长,分析序列变异.首先采用引物热不对称PCR的基因组DNA步移法分离其基因组序列全长,然后通过克隆测序分析了MsPGIP2基因在3个苜蓿品种(‘润布勒’、‘苏普斯坦’与‘公农1号’)中的多态性.结果显示,MsPGIP2基因的基因组DNA序列全长1 126 bp,可分为信号肽、内含子和LRR区3部分.MsPGIP2基因的基因组序列中共有46个变异位点(频率＞0.02).在信号肽区,没有变异位点;在内含子区,有5个SNP位点和2个InDel变异位点;而在LRR区,共发现了39个SNP位点,其中非同义突变占61.5％.在3个苜蓿品种中共发现了15个等位基因(即单倍型),通过对LRR区核苷酸的系统发育分析将他们分成3类.结论认为,MsPGIP2基因具有较大的变异,各等位基因间发生了频繁的重组交换,是一个为适应病原微生物PG的进化而快速进化的基因.

关键词：紫花苜蓿、PGIP基因、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：24

分类号：S184;Q71(农业生物学)

资助基金：国家自然科学基金青年项目31201840;天津市高等学校创新团队培养计划TD12-5017

在线出版日期：2017-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1073-1079