象草PAL基因克隆及其蛋白质结构与功能预测

摘要：

苯丙氨酸解氨酶(PAL)是植物木质素生物合成途径中的关键酶,参与木质素、类黄酮和花青素等次生代谢产物的形成.本研究以‘N51’象草(Pennisetum purpureum)为材料,通过同源克隆、3'RACE和hi-Tail PCR的方法,对PAL基因进行克隆,得到PpPAL cDNA序列2429 bp以及DNA序列全长3907 bp.PpPAL编码的蛋白包含720个氨基酸,具有典型的GTITASGDLVPLSYIAG苯丙氨酸解氨酶保守活性基序.运用生物信息学进行分析,PpPAL基因cDNA序列与玉米(Zea mays L.)ZmPAL的相似性最高为94％,与其他禾本科植物也有着较高的相似性.在氨基酸序列系统进化分析中,PpPAL与ZmPAL遗传距离最近,并与其他禾本科植物PAL聚为一类.PpPAL蛋白的三维结构模型显示,PpPAL蛋白具有典型的“海马状”结构,表明PpPAL是典型的苯丙氨酸解氨酶家族,对木质素的合成起着重要的作用.

关键词：象草、木质素、苯丙氨酸解氨酶、生物信息学

所属期刊栏目：24

分类号：S543.9;Q943.2(饲料作物、牧草)

资助基金：国家自然科学基金31272491,30972138;教育部高等学校博士学科点专项科研基金20124404110011

在线出版日期：2016-05-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：137-145