鸭茅根组织实时定量PCR分析中候选内参基因的筛选

摘要：

实时荧光定量PCR(qRT PCR)技术已成为研究基因表达的重要技术之一.以鸭茅(Dactylis glomerata)根组织为材料,利用qRT PCR技术检测ACTIN(肌动蛋白酶)、TCTP(翻译控制肿瘤蛋白酶)、UBC(泛素结合酶)、ZTL(ZTL蛋白酶)、GAPDH(甘油醛3磷酸脱氢酶)和SAMDC(腺苷甲硫氨酸脱羧酶)6个候选内参基因在不同非生物胁迫环境下的表达情况,并运用Genorm 3.5,Delta Ct method,NormFinder 0.953,Bestkeeper 1.0和RefFinder软件分析各候选内参基因在鸭茅根组织中的表达稳定性.结果表明:6个候选内参基因综合表达稳定性从高到低排序为ACTIN,TCTP,GAPDH,UBC,ZTL,SAMDC;在干旱胁迫、盐胁迫、涝胁迫、热胁迫与ABA处理条件下,表达稳定性最高的基因是ACTIN;在涝胁迫条件下,表达稳定性最高的基因是TCTP;在不同的胁迫条件下,表达稳定性最低的基因是SAMDC.综合分析可知,基因ACTIN和TCTP最适合作为鸭茅非生物胁迫研究的候选内参基因,这可为鸭茅非生物胁迫下各种基因表达研究奠定基础.

关键词：鸭茅、实时荧光定量PCR、非生物胁迫、候选内参基因、根组织

所属期刊栏目：22

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：国家973计划2014CB138705;国家现代牧草产业技术体系CARS-35-05;国家级大学生创新计划201310626002

在线出版日期：2014-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：847-853