燕麦核不育雄蕊转录组测序及分析

摘要：

以重组自交构建的燕麦(Avena L.)近等基因系为研究对象,通过构建转录组测序文库并进行Illumina RNA-seq双端测序及生物信息学分析,了解雄蕊生长发育过程,特别是花粉发育基因调控过程.共获得原始数据23.13Gb,有效数据20.61 Gb.通过de novo拼接,获得的unigene总长度约为95.95 Mb,均contig长度为716 nt,N50长度为1.07 kb.转录物注释结果显示,82992条转录物序列具有同源比对信息,COG和GO功能分类工具分别将已注释转录物序列划分为25个和56个功能类别.通过对2个材料间转录物序列及表达水平比较,初步确定在雄蕊形成过程中3643条序列表达量上调,50条序列表达量上调10倍以上;12312条序列表达量下调,2041条序列表达量下调10倍以上.

关键词：燕麦、雄蕊、RNA-seq、生物信息学分析

所属期刊栏目：22

分类号：Q943.1;Q944.58(植物学)

资助基金：山西省农科院博士基金项目YBSJJ209;国家燕麦荞麦产业技术体系CARS-08-A-1

在线出版日期：2014-05-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：352-358