芦竹属菌草的分子鉴定及适应性进化分析

摘要：

目前芦竹属(Arundo)菌草形态学的鉴定方法已经建立,但是在分子水平上的研究较少.对芦竹属菌草进行分子鉴定与选择压力分析可为菌草的杂交育种奠定基础.本研究通过PCR扩增得到芦竹属菌草的ITS2 基因序列,并对它们的叶片进行转录组测序,通过生物信息学方法对其进行分子鉴定与选择压力分析.结果表明:在 6.21 百万年-9.75 百万年前,以及 5.14 百万年-8.07 百万年前分别进行了两次大规模的分化,将它们分为 3 大类('绿洲 3 号''绿洲5 号''绿洲 6 号''绿洲 8 号'、'绿洲 2 号''绿洲 4 号''绿洲 7 号''绿洲 12 号'和其他菌草).选择压力分析筛选出'绿洲1 号'和'绿洲 3 号'的正选择基因,它们大部分与转录调控、抗逆与发育相关.研究结果揭示了芦竹属菌草品种之间的关系和受到正向选择的基因与位点,为芦竹属菌草的适应性进化提供见解,也为今后的遗传改良提供靶点.

关键词：芦竹、ITS2序列、系统发育、转录组、分歧时间、选择压力

所属期刊栏目：40

分类号：S852.65;Q943.2;R373.2

资助基金：福建省重大专项;福建省农业农村厅农业资源保护与利用专项

在线出版日期：2023-07-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：1568-1581