空心莲子草MTP基因家族的鉴定、 特征及表达分析

摘要：

金属耐受蛋白(MTP)是阳离子转运蛋白家族(cation transporter family,CDF)的重要成员,在植物重金属转运及解毒中发挥关键作用.为系统鉴定和分析空心莲子草MTP基因家族(ApMTP),本研究以模式物种MTP序列作为种子序列,BLASTP比对空心莲子草氨基酸序列数据库,成功鉴定到40个ApMTP候选,随后对它们进行了系统发育、保守结构域、基因结构等生物信息学分析.结果 表明:鉴定到的40个ApMTP中,大部分成员含有2～6个跨膜结构域(transmembrane domain,TMD);系统发育分析将40个ApMTP分为Fe/Zn-CDF(7)、Mn-CDF(20)和Zn-CDF(13)3个亚家族;在Zn-CDF和Zn/Fe-CDF亚家族ApMTP的TMD-Ⅱ和TMD-V上或附近识别到保守基序HXXXD,在Mn-CDFs亚家族的TMD-Ⅱ和TMD-V上识别到保守基序DXXXD.表达模式分析发现,ApMTP具有组织特异性表达和响应根部低钾等不同处理的特征.

关键词：生物信息学分析、重金属、CDF家族、锌转运蛋白

所属期刊栏目：37

资助基金：国家自然科学基金;长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心开放基金

在线出版日期：2020-10-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1516-1527