基于转录组测序对紫花苜蓿铅胁迫相关基因的富集分析

摘要：

本文采用高通量Illumina Hiseq测序平台对紫花苜蓿(Medicago sativa)的铅胁迫处理组(Pb96)和对照组(CK)进行转录组测序,并对测序数据进行分析,探究紫花苜蓿抗铅应答的分子机制.结果 表明,在铅胁迫处理下共检测到2 242个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs).其中,1 321个DEGs上调表达,921个DEGs下调表达.GO (Gene ontology,http://www.geneontology.org/)富集分析,差异表达基因主要涉及物质代谢、蛋白结合、催化活性等.KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes,http://www.genome.jp/kegg/)分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、淀粉和蔗糖代谢等.COG (Clusters of orthologous groups of proteins/orthologous groups of genes)分析,差异基因主要涉及“碳水化合物的运输和新陈代谢”、“翻译、核糖体结构和生物发生”、“次生代谢产物的生物合成、转运和分解代谢”等.本研究通过对紫花苜蓿根系转录组分析,为研究紫花苜蓿耐铅分子机制提供参考.

关键词：紫花苜蓿、转录组、铅胁迫、耐铅基因

所属期刊栏目：36

分类号：S541+.9(饲料作物、牧草)

资助基金：吉林省科技厅科技支撑计划“优质饲草品种选育及其配套种植技术研究与示范”20180201072ny;吉林省教育厅科学技术研究项目“紫花苜蓿细胞质雄性不育系的细胞学和生理生化特性的研究”JJKH20180666KJ

在线出版日期：2019-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2525-2534