偃麦草EST-SSR标记开发及应用

摘要：

利用NCBI数据库中偃麦草(Elytrigia repens)EST序列开发偃麦草EST-SSR引物,并对47份偃麦草资源进行遗传多样性分析,验证所开发EST-SSR引物在偃麦草上的可应用性.结果显示,在27 891条偃麦草EST序列中可以搜索到SSR位点1 068个;其中六核苷酸重复序列最多,占总SSR的53.83％;二、三、四、五、六核苷酸优势重复基元及出现频率分别为AC/TG(2.72％)、CGC/GCG(1.87％)、CGAC/GCTG(5.24％)、CCGCC/GGCGG(0.37％)、CAGCTC/GTCGAG(3.37％).开发的105对偃麦草EST-SSR引物中有64对引物(60.95％)可以有效扩增;随机选取18对多态性引物对47份偃麦草进行遗传多样性分析,其多态性百分率为78.64％,多态性指数(PIC)为0.22～0.83.以上结果表明,开发的偃麦草EST-SSR标记是有效的,有较高的应用价值,为偃麦草遗传多样性、重要性状关联分析研究奠定了基础.

关键词：偃麦草、EST-SSR、标记开发、遗传多样性

所属期刊栏目：33

分类号：S540.1;Q943(饲料作物、牧草)

资助基金：国家自然科学基金31360580;新疆农业大学研究生科研创新项目XJAUGRI2015002

在线出版日期：2016-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1526-1535