基于RNA-Seq技术的苜蓿根蘖性状发生相关下调基因

摘要：

为了从分子水平上分析苜蓿(Medicago sativa)根蘖性状的发生机制,对根蘖型苜蓿的根蘖与非根蘖根部进行RNA-seq转录组文库构建,并分析差异表达基因及其功能.分别提取品系“BL-101”的根蘖型苜蓿根蘖与非根蘖部位总RNA,利用磁珠法分离mRNA后通过PCR扩增构建RNA-Seq转录组文库,并对差异表达基因进行分析,得到差异表达基因15 978条,本研究重点分析下调基因,通过生物过程分类,发现与根蘖性状发生有关的表达下调的基因为5个,经生物学信息分析确定,其中2个属于Lon蛋白酶家族,其余分别属于植物肌动蛋白酶家族,硫氧还蛋白和脂氧合酶,其与植物抗逆性相关,且与植物激素ABA的调控有关.研究结果可以为探讨苜蓿根蘖性状发生的分子机制提供理论依据.

关键词：苜蓿、根系生长、生物信息学、脱落酸

所属期刊栏目：33

分类号：S551+.703;Q943.2(绿肥作物)

资助基金：国家自然科学基金——基于RNA-seq技术的苜蓿根蘖性状发生分子机制研究31201843;北京林业大学校级大学生创新项目——基于RNA-seq技术的苜蓿根蘖性状发生分子机制的研究X201410022009

在线出版日期：2016-06-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：75-85