家蚕微孢子虫全基因组分泌蛋白的预测分析
分泌蛋白是一类重要的介导病原与宿主相互作用的因子.微孢子虫专性细胞内寄生的生活方式决定了分泌蛋白在其侵染、增殖、防御和调控宿主生理活动中具有重要的作用.利用真核生物分泌蛋白预测流程EuSecPred 1.0对家蚕微孢子虫全基因组的分泌蛋白基因进行预测和严格条件筛选,鉴定获得97个分泌蛋白基因,占基因组全部编码基因的1.87％.对分泌蛋白的功能和结构域进行注释分析,发现了孢壁蛋白、丝氨酸蛋白酶抑制剂(Serpin)和Ricin B-凝集素等重要侵染相关因子.氨基酸组成分析表明,家蚕微孢子虫分泌蛋白及其信号肽主要由疏水性氨基酸组成,而信号肢剪切位点主要由亲水性氨基酸组成.基序分析发现,分泌蛋白信号肽中存在保守基序T[ILV][IVL][LI][VIL][LI] LS[IV]I[AK][SA],分泌蛋白内部存在[ES]W[VLM]K和YF[FY][DG]L2种基序.在全基因组范围对家蚕微孢子虫的分泌蛋白进行预测分析,有助于进一步研究家蚕微孢子虫致病相关的候选因子.
家蚕微孢子虫、基因组、分泌蛋白、信号肽、基序
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Q959.115+.92;Q811.4(动物学)
国家自然科学基金青年基金项目31001036/C1703;重庆市自然科学基金项目CSTC,2010BB1139;国家自然科学基金重点项目30930067/C120110;国家自然科学基金项目31072089/C1703;中央高校基本科研业务费专项XDJK2009C148
2013-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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