家蚕蛋白质数据检索系统

摘要：

蛋白质组研究对于基因功能的阐释具有极其重要的作用.为了使研究者方便快捷地查询到家蚕蛋白质组数据,以已鉴定的家蚕蛋白质数据为基础,在NetBeans 6.5开发环境中,于Rails 2.2.2编写框架下采用ruby 1.8.6语言,利用MySQL数据库实现对数据储存与调用,构建了家蚕蛋白质数据检索系统(http:∥www.silk2db,org:3000).该系统不仅收录了已鉴定家蚕蛋白质的基础信息,还收录了试验条件、质谱峰图、肽段检索参数和参考文献等信息.研究者可以根据试验名称、家蚕组织或器官名称、登录号、蛋白质的等电点和分子质量范围等实现对这些蛋白质相关信息的快速查询.该系统数据可为家蚕基因功能研究提供有益信息和重要支撑,并能为家蚕蛋白质组学试验方法的探索与改进提供线索.

关键词：家蚕、蛋白质组、数据库、检索

所属期刊栏目：37

分类号：S881.2;Q591.2(蚕桑)

资助基金：国家教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队IRT0750;国家自然科学基金项目30972147;西南大学研究生科技创新基金优博项目Kb2009003

在线出版日期：2012-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：993-999