家蚕质型多角体病毒RDRP基因的序列测定及同源性分析

摘要：

应用分段RT-PCR方法和分子克隆技术从家蚕质型多角体病毒(Bombyx mori cytoplasmic polyhedrosis virus,BmCPV)中国株的dsRNA中成功地分3段克隆了RDRP基因(RNA-dependent RNA polymerase),大小分别为1 442、827、1 675 bp,进行了基因全序列拼接,获得3.7 kb的全长RDRP基因(GenBank序列号为:AY496445).通过在线blast分析,与BmCPV-1、DpCPV-1、LdCPV-1、LdCPV-14、TnCPV-15核苷酸同源性分别为89%、81%、81%、54.1%和50.9%,氨基酸同源性分别为96.5%、93.1%、92.9%、41.1%和33.5%.根据核苷酸同源性与氨基酸同源性构建的进化树具有较好的一致性.通过ClustalX软件分析,定位了该病毒RDRP基因的3个保守区域(酸性区,核苷酸结合的核心区和催化功能核心区).

关键词：家蚕质型多角体病毒、dsRNA、RDRP基因、同源性

所属期刊栏目：31

分类号：S884.5;Q78(蚕桑)

资助基金：国家科技攻关项目2001BA502B01-02-03;国家自然科学基金370169

在线出版日期：2005-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：53-58