伽师瓜和86-1甜瓜几丁质酶基因的克隆与序列分析

摘要：

以新疆主产不同耐藏性的甜瓜品种伽师瓜(耐藏性好)和86-1甜瓜(新密11号,耐藏性差)为试料,利用甜瓜基因组辅助设计引物克隆几丁质酶基因的cDNA序列,分别对其编码序列(CDS)及编码氨基酸进行相关生物信息学的预测分析,以期通过研究二者之间基因的差异揭示伽师瓜和86-1甜瓜采后不同耐藏性的机制.结果表明,获得的伽师瓜几丁质酶基因(JiaShi Melon chitinase,JSMC2),NCBI检索号为KT921406;86-1甜瓜几丁质酶基因(XinMi-11 melon chitinase,XMMC),NCBI检索号为KU236388.JSMC2和XMMC序列长度均为1 011 bp,包含完整的开放阅读框,编码336个氨基酸,与黄瓜几丁质酶基因具有高度的同源性.蛋白结构域预测分析表明,甜瓜几丁质酶蛋白包含GH 18_hevamine_XipⅠ_class_Ⅲ、Chi1、GH 18_chitinase-like super family、Glyco-hydro-18和Glyco_ 18保守结构域,可催化几丁质水解成N-乙酰葡糖胺,分解真菌细胞的细胞壁,抵御病原真菌的侵染.

关键词：甜瓜、几丁质酶、基因克隆、序列分析、耐藏性

所属期刊栏目：17

分类号：S652(瓜果园艺)

资助基金：新疆农业大学校前期资助项目XJAU201421

在线出版日期：2017-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：94-100,107