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摘要: 目的 利用药效团和分子对接等模拟方法,基于过氧化物酶体增殖物激活型受体 γ (PPARγ)-肝X受体α(LXRα)-三磷酸腺苷结合盒转运体Al(ABCA1)通路发现中药中具有降脂作用的潜在活性化合物.方法 首先,选择PPARγ和LXRα作为研究载体,分别构建其激动剂的药效辨识模型.通过对药效团模型的验证与评价,获得PPARγ和LXRα的最优药效团模型.随后,利用最优药效团模型筛选中药化学成分数据库(TCMD),结合Lipinski五规则及化合物与药效团模型的匹配度,得到初筛化合物.最后,利用分子对接方法进一步精简筛选结果,保留对接打分值较高的化合物,并分析其关键氨基酸,分别得到PPARγ和LXRα的潜在激动剂.结果 本研究构建了PPARγ激动剂的最优药效团模型,包括1个氢键受体、1个疏水基团和2个芳香基团;LXRα的最优药效团模型,包括2个氢键受体、1个疏水基团和2个芳香基团.同时利用分子对接方法构建PPARγ和LXRα的蛋白三维模型,并将其用于分子对接研究.结合药效团及Lipinski五规则的筛选结果,分别获得20个和180个初筛化合物.依据筛选标准(打分值和关键氨基酸),最终确定鹰爪木脂醇和桧双黄酮为PPARγ的潜在激动剂,栝楼酯碱和刘寄奴酰胺为LXRα的潜在激动剂.筛选得到的PPARγ和LXRα潜在激动剂可以通过分别作用于PPARγ-LXRα-ABCA1通路上的对应靶标协同发挥降脂作用.结论 本研究高效、快速的筛选了TCMD中具有潜在活性的PPARγ和LXRα激动剂,用于协同上调ABCA1的表达,为高脂血症的药物研发提供先导化合物.
关键词: PPARγ-LXRα-ABCA1通路、药效团、分子对接、虚拟筛选、中药
所属期刊栏目: 41
分类号: R284.1(中药学)
资助基金: 国家自然科学基金资助项目81573831、81430094、81173522;国家"重大新药创制"科技重大专项No.2011ZX09401-028National Natural Science Foundation of China81573831,81430094,81173522;Major Scientific and Technological Project of“Major New Drugs Creation”2011ZX09401-028
在线出版日期: 2018-03-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
页数: 共9页
页码: 131-139
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