一种基于完全匹配和分词匹配的混合分词匹配算法

摘要：

如何高效准确地进行酶的鉴别是代谢网络重构的难点和关键.由于基因标注文件中与ORF对应的蛋白质和酶信息都是采用自然语言描述的,重构中必须利用基因产物在酶数据库中寻找证据,从而进行与代谢相关的酶鉴别.针对目前通用的酶鉴别算法识别率低、效率低的问题,论文在对生物数据特性分析的基础上,提出了一种完全匹配和分词匹配相结合的混合分词匹配算法对酶信息进行鉴别,实验结果和分析表明,该算法具有更好的鉴别能力和更高的效率.

关键词：代谢网络重构、Pathohgic算法、混合匹配算法、酵母菌、大肠杆菌

所属期刊栏目：27

分类号：R318.04(医用一般科学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划2006CB910700

在线出版日期：2009-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：591-595