枣果胶甲酯酶基因家族鉴定及基于RNA-Seq表达分析

摘要：

[目的]果胶是植物细胞壁的主要成分和结构多糖.果胶甲酯酶(PME)是一种重要的果胶修饰酶,具有调节细胞壁弹性和通透性的作用,在植物的生长发育过程中发挥作用.本研究探讨枣果胶甲酯酶基因家族的基本信息和特点,为进一步阐明ZjPMEs基因的功能、筛选果实质地密切相关基因奠定基础.[方法]本研究基于'冬枣'基因组,鉴定枣基因组中的果胶甲酯酶基因;基于RNA-Seq数据,分析枣果胶甲酯酶基因家族的特征以及表达模式.[结果]共鉴定出46个枣果胶甲酯酶基因,不均匀分布在10条染色体上.系统演化分析表明这些基因包含29个Type-Ⅰ型和17个Type-Ⅱ型成员,进一步可以划分为4个亚家族.在每个亚家族中,基因共享保守的基因结构和基序组成.基因表达分析显示该家族基因在花中表达丰度较高,可能在枣的生殖发育过程起重要作用.通过分析该家族基因在不同质地的'冬枣'(酥脆)和'P15'(硬质)以及在不同用途的'冬枣'(鲜食)和'骏枣'(制干)果实发育过程中的表达模式,筛选出与枣果实质地关系密切的基因ZjPME 18,该基因在'P15'和'骏枣'果实中表达量较高.[结论]枣果胶甲酯酶基因家族具有特定的结构特征及表达模式,ZjPME 18的表达与调控可能与枣果实质地密切相关.

关键词：枣、果胶甲酯酶、基因家族、表达模式

所属期刊栏目：43

分类号：S722.3(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家科技计划重大专项课题2018YFD1000607

在线出版日期：2021-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：8-16