基于生物信息学分析LAMB3在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义

摘要：

目的 基于生物信息学方法,通过HPA、TCGA和GEPIA等多个数据库探讨LAMB3在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)中的表达及临床意义.方法 HPA数据库分析LAMB3 mRNA和蛋白在不同部位的表达.R软件通过TCGA数据库分析LAMB3 mRNA在OSCC和正常对照样本中的表达差异及与临床病理特征间的关系.GEPIA、TCGA数据库应用Log-rank法行预后分析.BioGRID数据库分析与LAMB3 具有交互作用的基因.R软件通过TCGA数据库筛选LAMB3 在OSCC中的共表达基因并行富集分析.STRING数据库筛选并构建LAMB3共表达基因的蛋白质互作网络(protein-protein interaction network,PPI network).结果 人正常样本中LAMB3 mRNA在舌部表达最高.LAMB3 蛋白在2例正常口腔黏膜样本和2例OSCC样本中均为中度表达.LAMB3 mRNA在OSCC中表达上调,与临床分期、年龄和总生存率相关,与肿瘤分化程度和性别不相关.OSCC中LAMB3的共表达基因中正相关145个、负相关4个.PPI network中具有相互作用关系最多的前10位基因里多为整联蛋白家族成员(ITGA3、ITGA5、ITGA6、ITGB4).结论 LAMB3 在OSCC中呈高表达,其高表达与年龄和临床分期相关且预后较差,并且与共表达基因中的整联蛋白在OSCC发生或发展相关的功能与通路的调控机制中关系密切,可为LAMB3为靶点的OSCC临床诊断或治疗提供新的研究方向和依据.

关键词：口腔鳞状细胞癌、LAMB3、生物信息学、整联蛋白

所属期刊栏目：31

分类号：R739.8(肿瘤学)

在线出版日期：2023-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：241-246