金线莲ArLBD1基因克隆、亚细胞定位及表达分析
以金线莲(Anoectochilus roxburghii)叶片的转录组数据为基础,采用RT-PCR技术克隆到了金线莲ArLBD1转录因子基因,采用生物信息学、原核表达、Western blot、亚细胞定位及qPCR等方法对该基因功能进行初步分析,以期为进一步研究其功能提供参考依据.结果表明:ArLBD1基因CDS长度864 bp,编码287个氨基酸.ArLBD1蛋白分子量为30.62 kD,理论等电点为6.25,不稳定系数55.55,属于不稳定蛋白.ArLBD1蛋白含有LOB superfamily保守结构域,第7~28氨基酸为C基序,第36~84氨基酸为GAS基序,第89~107氨基酸为类亮氨酸拉链基序,具有完整的类亮氨酸拉链基序,属于Class Ⅰ.系统进化分析表明ArLBD1与拟南芥AtLBD36的亲缘关系最近,其次是AtLBD6.SDS-PAGE电泳及Western blot结果显示,ArLBD1基因在大肠杆菌中成功诱导表达.亚细胞定位分析发现ArLBD1蛋白定位在细胞核.qPCR分析结果表明,ArLBD1基因在金线莲叶、茎和根中都能检测到表达,在叶片表达量最高,其次是根,茎的表达量最低,推测Ar-LBD1基因主要在金线莲叶片发育中发挥功能.
金线莲、ArLBD1、亚细胞定位、基因克隆、原核表达
S567.5+3(经济作物)
福建省属公益类科研院所基本科研专项资助项目;福建省农业科学院科技创新团队资助项目
2024-01-31(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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