基于花脸香蘑基因组的SSR分子标记开发

摘要：

以4个花脸香蘑菌株及已公布的花脸香蘑基因组为试材,采用生物信息学和试验验证相结合的方法,研究了花脸香蘑基因组上的SSR类型及分布,设计了 50对SSR引物开展试验验证,以期为花脸香蘑的种质资源鉴定、品种选育、分子标记辅助育种等研究提供参考依据.结果表明:总计检索到7种SSR类型的2 486条序列,其中主要以单碱基(P1)类型为主,占总SSR的67.70％,且分布密度较高;四、五、六碱基重复的类型较多,但数量较少.由验证试验获得4对多态性高、重复性好、特异性好的引物,分别为HLMSSR001、HLMSSR004、HLMSSR015 和 HLMSSR041.其中,HLMSSR001 和 HLMSSR004 可以通过单一的引物扩增即可将4个花脸香蘑菌株进行区分鉴定.同时,基于4对引物进行花脸香蘑DNA指纹编码的构建,获得了 4个花脸香蘑菌株唯一的8位数分子指纹数据库编码.

关键词：花脸香蘑、基因组、SSR、标记开发

分类号：S646.1+2

资助基金：云南省重大科技专项计划资助项目;云南省科技人才与平台计划资助项目

在线出版日期：2023-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：112-120