樱桃绿环斑驳病毒(CGRMV)外壳蛋白基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

以感染樱桃绿环斑驳病毒(Cherry green ring mottle virus,CGRMV)的甜樱桃叶片为试材,采用RT-PCR和生物信息学分析的方法,研究了樱桃绿环斑驳病毒外壳蛋白(coat protein,CP)基因的核酸序列、进化关系以及蛋白性质和结构,以期为CGRMV的检测及外壳蛋白功能的研究提供参考依据.结果表明:克隆的CGRMV-CP(MW201963)全长807个核苷酸,编码由268个氨基酸残基组成的29.71 kD蛋白.其与17个已报道分离物CP的序列分析显示,核酸序列同源率为75.84％～96.28％,氨基酸一致率为81.72％～98.51％,与来自美国的李树(KC218931.1)进化关系最近.克隆的CGRMV-CP是等电点pI为8.25的疏水性非跨膜蛋白,二级结构由6个α-螺旋,7个β-片层和无规则卷曲构成.

关键词：樱桃绿环斑驳病毒、外壳蛋白、序列分析

分类号：S662.5(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金;山东省自然科学基金资助项目;枣庄学院博士启动基金资助项目;枣庄市科技计划资助项目

在线出版日期：2022-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：10-15