番茄ERFb.2转录因子的克隆、生物信息学及表达特征分析

摘要：

通过克隆番茄SlERFb.2基因,并运用生物信息学对该基因的编码产物进行一级、二级、三级结构分析,并通过qRT-PCR技术检测SlERFb.2基因在不同处理不同时期的表达量,以期为番茄对非生物胁迫的响应机制提供参考依据.结果 表明:SlERFb.2基因含有开放阅读框5个,共编码258个氨基酸,属于酸性蛋白;其二级结构以α-螺旋为主,预测蛋白定位于细胞核上;且含有39个磷酸化位点与15个糖基化位点;启动子区主要以I-box为主,且含有多个诱导基因表达的顺势作用元件;三级结构相对简单,且该转录因子在番茄中存在4个互作蛋白,系统发育树得番茄与马铃薯的亲缘关系最近;qRT-PCR显示该基因对低温的响应特别敏感.

关键词：番茄;EFRb.2;生物信息学;表达分析

分类号：S641.2

资助基金：国家自然科学基金;甘肃省教育厅优秀研究生创新之星资助项目

在线出版日期：2022-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1-10