菊花ClERF1基因的克隆与表达分析

摘要：

以甘菊叶片为试验材料,采用RT-PCR和Tail-PCR以及生物信息学的方法,研究了甘菊ClERF1及其启动子序列特征、表达模式,以及甘菊ClERF1在低温胁迫下的响应.以期为进一步研究甘菊ClERF1功能提供参考依据.结果表明:ClERF1基因序列全长1 242 bp,最大开放阅读框(ORF)618 bp,可编码206个氨基酸.经理化性质分析,ClERF1分子量23 631.35 Da,理论等电点5.19,不稳定系数53.84,脂肪指数62.04,平均亲水性-0.786,亚细胞定位在细胞核内.系统进化树表明,ClERF1与拟南芥At3g23240亲缘关系最近,属于ERF亚家族.qRT-PCR分析表明ClERF1在叶片中表达最高,其次在茎段中.该研究克隆了C1ERF1启动子序列1 534 bp,主要包括低温反应和乙烯响应元件、生长素和茉莉酸甲酯反应元件等.甘菊低温处理幼苗ClERF1表达量显著高于未低温处理的幼苗,其中5℃时ClERF1相对表达量最高.

关键词：菊花、AP2/ERF、基因克隆、启动子元件

分类号：S718.43(林业基础科学)

资助基金：国家自然科学基金地区科学基金资助项目;吉林省"十三五"科学技术资助项目;延边大学青年基金资助项目;延边大学博士科研启动基金资助项目;农业农村部景观设计重点实验室开放课题资助项目

在线出版日期：2021-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：66-72