南瓜HSP70蛋白家族的鉴定和生物信息学分析

摘要：

热激蛋白70(heat shock protein 70,HSP70)是植物应对逆境胁迫产生的一类特定的应激蛋白.以南瓜基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对南瓜HSP70基因家族进行鉴定分析,并对蛋白特征、基因结构、保守结构域和启动子序列进行研究.结果 表明:南瓜基因组数据库中含有10个HSP70,编码的蛋白序列长度为572～843个氨基酸,HSP70蛋白含有6～8个保守结构域,可分为4个亚家族.基因结构分析表明HSP70具有0～8个内含子.启动子元件分析显示HSP70的启动子含有多个信号元件,说明HSP70可能参与多种功能的调控.研究结果为下一步研究HSP70家族蛋白的功能奠定基础.

关键词：南瓜、热激蛋白70、生物信息学、启动子分析

分类号：S642.1

资助基金：海南省瓜菜育种工程技术研究中心开放课题资助项目GCYZGCZX2017001;海南省重点实验室和工程技术研究中心建设专项资助项目JSZX009

在线出版日期：2019-10-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：7-13