苹果基因组中转录因子的鉴定与分析

摘要：

转录因子是基因表达调控过程中的重要调节因子.为更好地了解蔷薇科植物苹果转录因子所编码的基因家族,利用苹果基因组数据进行转录因子筛选鉴定和系统预测,并与桃和草莓2个蔷薇科物种进行分析比较.结果表明:在苹果、桃、草莓中分别鉴定到3 039、1 527、1 506个转录因子成员,可分为58个转录因子家族;基因染色体定位显示预测的转录因子以不同密度分布在所有染色体上;所有的转录因子都具有类似的GO分析结果和亚细胞定位预测信息;随机选择了与拟南芥MYB转录因子同源性较高的苹果基因进行了干旱胁迫处理下的表达量检测,值得注意的是,有6个基因经过PEG处理后在平邑甜茶和T337苹果品种中的表达量具有相似的变化趋势.该研究系统分析鉴定苹果全基因组中的所有转录因子基因家族,为今后深入了解蔷薇科植物转录因子的分类和基因功能研究提供了一定的参考依据.

关键词：苹果、基因组、转录因子、鉴定分析、干旱

分类号：S661.103.6(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金青年资助项目31400225;潍坊市科技发展计划资助项目2016GX016;山东省自然科学基金资助项目2014ZRB01AAC

在线出版日期：2018-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：42-50