马蔺DFR基因的克隆及生物信息学特征分析

摘要：

以马蔺花瓣为试材,通过转录组测序,应用PCR技术克隆马蔺花青素生物合成关键酶二羟黄酮醇-4-还原酶(dihydvroflavonol-4-reductase,DFR)基因并获得其生物信息学特征.结果表明:马蔺DFR基因全长1 427 bp,共编码357个氨基酸(该基因命名为IIDFR,GenBank登录号为KY907171).该基因在氨基酸水平上与多种植物的DFR具有较高的同源性,在系统进化上与同属的荷兰鸢尾(Iris hollandica)的DFR亲缘关系较近;预测其蛋白质相对分子质量为39.99 kDa,等电点为5.89,主要由α-螺旋和β-折叠构成,定位于细胞质,属于酸性亲水不含信号肽的不稳定类蛋白质.马蔺IlDFR有一段氨基酸序列‘VTGASGYVGSWLVMKLLRDGY’与大部分物种的DFR特有相对保守的NADPH结合域非常相似,只有4个氨基酸残基有所差异.

关键词：马蔺、转录组测序、花青素、二羟黄酮醇-4-还原酶、生物信息学分析

分类号：S682.1+9(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：2013年度宁夏回族自治区科技支撑计划资助项目

在线出版日期：2018-01-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：109-115