天山樱桃EST-SSR引物开发及PCR反应体系优化

摘要：

以新疆天山樱桃叶片为试材,从NCBI数据库中搜索天山樱桃EST序列,利用SS-RHunter 1.3软件查找SSR位点,结合Primer 6.0设计引物,通过正交实验和单因素试验优化天山樱桃SSR-PCR反应体系,并用最佳体系对所开发的引物进行验证,以期为研究天山樱桃遗传多样性、构建遗传连锁图谱奠定基础.结果表明:从58对备选引物中随机挑选30对引物进行试验,有21对引物能够扩增出特异性条带,有效扩增率为70％.20μL天山樱桃SSR-PCR最佳反应体系为dNTP 0.2mmol·L-1、引物0.4 μmol·L-1、Taq酶0.75 U、模板DNA 60 ng.

关键词：天山樱桃、引物开发、EST-SSR、体系优化

分类号：S662.503.6(果树园艺)

资助基金：国家林业公益性行业科研专项资助项目201304701-1;新疆维吾尔自治区园艺学重点学科基金资助项目2016-10758-3

在线出版日期：2017-08-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：108-114