云南昭通野生紫丁香蘑群体的遗传多样性分析
以采自云南昭通的66株野生紫丁香蘑(Lepista nuda,L.nuda)为研究对象,分析了其ITS序列及其单核苷酸多态性(SNP).结果表明:经结合形态和分子水平的鉴定,确定所采的野生蘑菇为紫丁香蘑;66个紫丁香蘑的ITS序列长度变化范围为666~671 bp,ITS1为241~244 bp,5.8S为155 bp,ITS2为267~275 bp,G+C含量的变化范围为41.5%~42.4%,所有样本的平均遗传距离为0.003 0;通过序列比对,共筛选出7个SNP位点,单突变位点3个,简约信息位点4个转换与颠换的比值R为0.672;该群体的核酸多态性指数Pi为0.002 91,每位点核苷酸多态性指数Theta(per site from Eta)为0.002 36.采用邻接法(neighbour joining,NJ)构建的系统发育树分支支持率低,表明群体内各菌株遗传距离小,该群体的遗传多样性丰度较低.综上说明云()昭通野生紫丁香蘑群体的遗传多样性水平很低,需要加强保护.
紫丁香蘑、ITS、SNP、遗传多样性
S646.1+9
云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设资助项目50097505;云南省应用基础研究计划资助项目2011FZ141;西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室开放基金资助项目KL200707;云南省高校特色专业建设点资助项目50116001.
2015-10-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
132-136