黄绿蜜环菌SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

摘要：

以CTAB法提取的黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens) DNA为模板,应用L16(45)正交实验设计,对Mg+、dNTPs、引物和Taq DNA聚合酶、模板浓度5种因素进行SSR-PCR反应体系优化,建立了适合黄绿蜜环菌SSR-PCR反应的最佳体系并对退火温度进行检测.结果表明:在15μL反应体系中包括:1×PCR Buffer,100 ng模板DNA,dNTPs 217ìmol/L,引物0.5 μmol/L,Taq DNA聚合酶0.75 U,Mg2+ 1.3 mmol/L.稳定性检测证明,该反应体系具有较高的稳定性和重复性,并从34对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物8对.该体系的建立为今后利用SSR标记对黄绿蜜环菌遗传多样性研究、亲缘关系分析及种质资源鉴定等研究提供了依据.

关键词：黄绿蜜环菌、SSR-PCR、体系优化、正交设计、引物

分类号：S503.53

资助基金：国家自然科学基金资助项目31260021;青海省自然科学基金资助项目2011-z-724;国家重点实验室培育基地青海省高原作物种质资源创新与利用重点实验室开放课题资助项目2011-05

在线出版日期：2013-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：114-119