西藏光核桃SRAP-PCR反应体系的优化和引物筛选

摘要：

以西藏12份光核桃种质为试材,采用正交设计,从dNTPs、Mg2+、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素5个水平来优化SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了筛选.结果表明:光核桃25 μL的SRAP反应体系的最佳组分包括2.5 μL 10×buffer,0.35 mmol/L dNTPs,1.5 mmol/L Mg2+,0.4 μmol/L引物,20 ng模板DNA和2.5 U Taq DNA聚合酶.各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以dNTPs浓度影响最大,模板DNA的影响最小.应用该体系从40个引物组合中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物组合23个.这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为利用SRAP标记技术进行光核桃遗传多样性研究提供了依据.

关键词：光核桃、SRAP、正交设计、体系优化、引物筛选

分类号：S664.1(275)(果树园艺)

资助基金：西藏自治区科技厅杰出青年科学计划基金资助项目藏科发2009162号;四川农业大学博士后基金

在线出版日期：2011-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：139-143