引起2017年兰州市一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的CV-A2的基因特征分析

摘要：

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法进行肠道病毒型别鉴定.根据VP1区核苷酸差异选择3个毒株进行二代测序,获取全基因组序列.使用MEGA软件(版本号11.0)进行病毒的核苷酸,氨基酸相似性分析,VP1区的氨基酸突变位点分析,并构建系统发育树,使用Simplot(版本号3.5.1)软件进行病毒重组分析.本次疫情中分离到的毒株鉴定为柯萨奇病毒A2型(Coxsackievirus A 2,CV-A2),分子分型显示属于D基因型,且VP1区第102位氨基酸发生了丙氨酸到甘氨酸(A102G)的突变,与省内2014-2015年分离到的两株CV-A2毒株在该位置的突变不同.重组分析发现,病毒在P2区和P3区发生了以CV-A4为主的重组事件.本次疫情的致病病原体CV-A2存在着VP1区氨基酸A102G的特征性变异及P2区和P3区的重组,需要加强对肠道病毒的变异和重组的监测和研究,以提升预警能力.

关键词：疱疹性咽峡炎、柯萨奇病毒A2型、基因组、特征性突变、重组变异、分子流行病学

所属期刊栏目：40

分类号：R373.2+3(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2024-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：574-579