江西一例iVDPV病例Ⅲ型脊髓灰质炎病毒基因特征分析

摘要：

分析江西一例免疫缺陷患者体内连续采集的15份粪便标本中分离到的Ⅲ型脊髓灰质炎病毒的全长VP1区基因特征.将从15份标本中分离到的14株Ⅲ型iVDPVs进行噬斑纯化,每个病毒随机挑取10个噬斑,接着进行逆转录-聚合酶链反应扩增,测定获取到的154株iVDPVs全长VP1区序列.通过系统发育分析和BEAST程序探究iVDPV病毒的进化特征,估算其进化速率和口服脊灰减毒活疫苗(attenuated oral polio vaccine,OPV)初始感染时间.14株iVDPVs与Ⅲ型脊髓灰质炎减毒疫苗株(Sabin Ⅲ)核苷酸和氨基酸同源性分别为97.8％～98.7％和97.6％～98.3％.相较于Sabin Ⅲ,14株iVDPVs VP1区第54位氨基酸发生了 A→V的突变,这可能导致温度敏感表型和衰减表型的改变.根据拓扑结构系统发育树被划分为3个Lineages,其中17049-1-8,17049-2-2和17049-2-9分别属于Lineage 1和Lineage 2,其余属于Lineage 3.具有Lineage 3序列特征的克隆是优势克隆,呈现出随时间持续分化的特征.BEAST程序估算的14株iVDPVs全长VP1区核苷酸平均进化速率为9.29×10-3/位点/年(95％置信区间:2.81×10-3-1.59×10-2),OPV初始感染时间为2012年11月 18 日.MCC 树(maximum clade credibility tree)显示前4个遗传分支的分化仅用了 40 d.14株Ⅲ型iVDPVs具有高度相关性,它们感染患儿后进化非常迅速,在慢性感染的早期便开始了谱系的分化.突变的不断积累和关键位点的改变可以引起iVDPVs神经毒力的变化,导致患儿出现AFP症状.iVDPV病例持续的排毒给脊灰根除目标的实现带来了巨大挑战,在脊髓灰质炎消灭的最后阶段及时调整免疫策略,继续维持较高的免疫覆盖率,保持iVDPV监测的灵敏性显得十分重要.

关键词：脊髓灰质炎病毒、免疫缺陷、口服脊灰减毒活疫苗

所属期刊栏目：39

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划;国家重点研发计划;北京市自然科学基金

在线出版日期：2023-05-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：468-476