广州市生活污水中埃可病毒11型循环动态变化及基因特征分析

摘要：

埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一.为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021年广州市生活污水EV监测获得的E11分离株进行VP1区基因扩增及测序,结合2019年广东省发生的两起E11新生儿感染事件及部分散发病例中获得的E11分离株,与全球E11参考株进行序列相似性分析和系统发生学分析.结果显示,2009-2021年生活污水EV监测中E11分离株的核苷酸及氨基酸相似性分别为72.8％～99.3％和84.5％～99.6％.监测发现,广州市2018-2019年在污水中检出大量E11,与两起新生儿感染事件及散发病例的分离株核苷酸相似性高达96.2％～99.2％,但序列间仍存在差异,两起新生儿感染及散发病例感染的毒株为不同来源.通过系统进化树分析发现,2018-2019年污水E11分离株及两起新生儿感染与散发病例E11亲缘关系较近,分子分型结果均为E11 D5基因型.2017年及以前的污水分离株以A1基因型为主,但也有C3和D5基因型,2018年开始则以D5基因型为主,与同时期EV感染病例基因型结果一致.而在2021年污水中则发现了 E11 E基因型,但广州暂未有该基因型的感染病例报道,仍需持续进行病例和环境监测.结果表明,生活污水监测能够及时反映EV在环境和人群中的循环动态变化,对EV引起的相关疾病起到预测预警作用.

关键词：埃可病毒11型、污水监测、基因特征、循环动态变化

所属期刊栏目：38

分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划2021YFC2302003

在线出版日期：2022-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1108-1116