1株人乳头瘤病毒6型山东地方株的全基因组序列分析

摘要：

人乳头瘤病毒6型(Human papillomavirus type 6,HPV6)是引起生殖器疣与复发性喉乳头瘤的主要病原体之一.为明确2019年济南市1例尖锐湿疣患者的病毒基因组序列特征,本研究提取其尖锐湿疣组织标本总DNA,分两段进行HPV6全基因组PCR扩增和步移法Sanger测序,将拼接后的序列与全球36条不同来源的HPV6全基因组序列进行对比分析.结果 显示,1013/19/JN/CHN/HPV6株(以下简称1013/HPV6)基因组全长8031bp,属于变异谱系B1,与全球不同地区HPV6分离株序列的同源性为98.4％～99.9％.1013/HPV6株与B1亚谱系参考株AF092932全基因组序列相比具有19个核苷酸变异位点,分布在7个开放阅读框架(Open Reading Frames,ORFs)和非编码区内.本研究首次分析了分离自中国大陆的HPV6全基因序列特征,研究结果为HPV分子进化的进一步研究和分型诊断试剂的优化提供了数据.

关键词：人乳头瘤病毒6型(HPV6);全基因组;序列分析;系统发生

所属期刊栏目：37

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：泰山学者工程专项经费资助项目;泰山学者青年专家计划

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1370-1375