柯萨奇病毒A9型山东地方株的进化遗传学特征

摘要：

柯萨奇病毒A9型(Coxsackievirus A9,CVA9)是常见的人类肠道病毒血清型,其感染可引起无菌性脑膜炎、脑炎等疾病.为探索其进化遗传学特征,本研究对山东省1991-2018年CVA9分离株的VP1完整编码区进行了序列测定,并与GenBank中获得的全球序列一并进行系统发生学和进化遗传学分析.结果 显示全球CVA9可分为Ⅰ-Ⅻ 12个基因型,优势基因型为Ⅶ,包括山东株在内的所有中国分离株均属于该基因型.进化遗传学研究显示,CVA9 VP1区序列的每年每个碱基的平均进化速率约为6.25×10-3,共同祖先起源于1919年.CVA9 VP1区的基因多样性在2003年以前无明显变化,2003年以后出现明显波动.本研究为我们了解CVA9的流行趋势和遗传变异提供了数据,对CVA9相关疾病的防控和诊断试剂的研发具有重要的现实意义.

关键词：柯萨奇病毒A9型(CVA9);系统发生学;进化遗传学;无菌性脑膜炎(AM)

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分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：泰山学者工程专项经费资助项目;研究方向:病毒性及疫苗可预防传染病防控;泰山学者青年专家计划;研究方向:基于同一健康理念和下一代测序技术新型病毒的发现、溯源和进化动态研究;国家自然科学基金

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1333-1340