SARS-CoV-2污染的进口冷链产品导致的一起大连本土新冠疫情

摘要：

2020年12月15日,大连市报告了4名码头冷链货物搬运工人SARS-CoV-2核酸检测呈阳性,在此之前,大连市已经连续136天没有报告本土病例.在这次大连COVID-19疫情(简称"大连新冠疫情")中,我们收集了2020年12月15日至2021年1月8日期间大连新冠疫情中全部感染者(83)及部分接触的轮船货物样本,其中确诊病例占61.45％(51/83),无症状感染者占38.55％(32/83).通过高通量测序,共获得76条SARS-CoV-2全基因组序列,其中72条(86.75％,72/83)来自临床样本,4条来自R国籍A货船上的冷链食品外包装样本.基因组分析数据显示,与武汉参考株(NC_045512)相比,76条全基因组分别存在12～16个核苷酸突变位点,共享12个核苷酸突变位点,符合B.1.1进化分支突变特征.结合病毒基因组学和现场流行病学调查结果综合分析表明,大连新冠疫情是一起由SARS-CoV-2污染的进口冷链产品感染码头工人导致的本土疫情,在传播过程中至少形成了3个病毒代际和3个相对独立的传播链.

关键词：COVID-19;冷链;SARS-CoV-2;基因组学;现场流行病学;分子流行病学

所属期刊栏目：37

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家重点研发计划;国家自然科学基金

在线出版日期：2021-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1283-1291