2010-2019年北京地区腹泻患儿中人腺病毒41型Fiber基因分子特征和进化分析

摘要：

人腺病毒41型(Human adenovirus 41,HAdV-41)是引起儿童腹泻的重要病原之一.为了解北京地区腹泻儿童中HAdV-41 Fiber基因的分子变异和遗传进化特征,选取2010-2019年首都儿科研究所附属儿童医院门诊腹泻患儿HAdV-41阳性的粪便标本,扩增Fiber全基因,使用多种生物信息学软件进行系统发生、遗传进化、种群演变和选择压力等分析.结果显示HAdV-41本地毒株存在1644碱基(547氨基酸)和1689碱基(562氨基酸)两种长度的Fiber基因,截短的15个氨基酸位于Fiber蛋白纤维轴区.Mann-Whitney U秩和检验提示检测到感染短Fiber基因的HAdV-41的患儿年龄更小(P=0.036).同源性分析结果显示Fiber基因的核苷酸和氨基酸序列同源性均大于97％,主要分为四个进化分支(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ),其中Ⅰ和Ⅲ是主要的流行分支,分支Ⅰ主要在国内流行,而分支Ⅲ全球均有流行.HAdV-41共祖起源可追溯到1856年,平均进化速率每年为6.81×105碱基替换/位点,10年间理论有效种群一直比较平稳呈缓慢下降趋势.压力选择分析表明,一个正向和三个负向选择位点均位于Fiber蛋白的纤维轴区.上述结果表明2010-2019年间不同进化分支的HAdV-41在北京地区流行,进化速率稳定.Fiber蛋白轴区存在两种不同类型的氨基酸缺失.

关键词：人腺病毒41型(HAdV-41);纤维蛋白;腹泻;分子进化

所属期刊栏目：37

分类号：R373.2+5(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金青年基金;题目:外壳蛋白penton和Fiber在腺病毒31型嗜肠道感染中的作用及机制研究;首都儿科研究所所级基金;题目:腺病毒31型外壳蛋白Fiber抗原表位的研究

在线出版日期：2021-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1102-1111