江西省2010年柯萨奇病毒A组24型变异株的全基因组序列分析
急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)是目前人类最常见的眼病之一,柯萨奇病毒A组24型变异株(Coxsackievirus A24 variant,CV-A24v)是近年来报道引起该病的主要病原体.本研究选取10株来自江西省2010年AHC暴发疫情的CV-A24v,采用特异性引物扩增并测定其全基因组序列.对该10条CV-A24v的全基因组序列进行系统发育分析以及重组分析,计算本研究测定的江西10条以及GenBank中所有22条CV-A24v的全基因组序列的氨基酸置换熵值,并预测其正向选择位点.结果表明,在江西10条CV-A24v基因组序列中未检测到重组.基于全基因组序列构建的最大似然树表明江西10株CV-A24v属于GIV基因型,且分处于两条传播链.对上述32条CV-A24v序列的氨基酸置换熵值计算,共得到25个易突变位点(熵值＞0.6),易突变概率最高的区段为2A区.基于Datamonkey中FUBAR和FEL模型分析,发现位于结构蛋白VP2区的234位氨基酸为两种模型共同获得的CV-A24v的正向选择位点.本研究分析了江西10株CV-A24v的全基因组序列特征,为CV-A24v引起的AHC防控工作提供了基础资料.
柯萨奇病毒A组24型变异株(CV-A24v)、急性出血性结膜炎(AHC)、全基因组、选择压力
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R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家科技重大专项;国家科技重大专项;国家科技重大专项
2021-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
89-96
