福建省2015～2018年风疹病毒分子流行病学特征

摘要：

风疹病毒(Rubella virus,RV)的分子流行病学监测是控制和消除风疹的重要途径.为了解福建省2015 ～ 2018年流行RV的变异特征,并探讨其流行规律,本研究收集2015～ 2018年福建省风疹病例咽拭子标本并开展病毒分离,采用RT-PCR方法扩增RV的E1基因739个核苷酸片段并进行序列测定,随后与WHO的13个基因型的32条RV参考株序列比对进行基因型别鉴定,并与GenBank数据库中2010年以来国内外流行1E和2B基因型RV代表株进行比对分析.最终从2015～2018年279例风疹病例中共分离获得113株RV毒株,基因型别鉴定结果显示,25株为2B基因型,88株为1E基因型,后者均来自2018年.2B基因型RV存在4个进化分支(Cluster 1 ～ 4),福建省2B基因型RV毒株均属于Cluster1分支,与国内多数省份流行情况一致.1E基因型RV存在6个进化分支(Lineage 0～5),福建省1E基因型RV毒株属于Lineage 5b分支,不同于我国2018年之前流行的1E基因型RV毒株(Lineage 1),两者之间的核苷酸和氨基酸遗传距离分别是0.035 ～ 0.050和0.030 ～ 0.042.与中国风疹疫苗株BRDⅡ株的氨基酸序列相比,福建省流行RV毒株的高突变位点位于A333,2B基因型为A333→V333,1E基因型为A333→T333.本研究提示,福建省2015～ 2018年的风疹流行是由2B和1E基因型RV共循环引起,在不同时期存在优势基因型的互换.2018年流行的1E基因型RV由境外输入的可能性较大.

关键词：风疹、风疹病毒(RV)、基因型、分子流行病学

所属期刊栏目：36

分类号：R373.9(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：福建省卫生计生委青年科研项目2015-1-22

在线出版日期：2021-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1123-1132