10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003775
埃可病毒7型分离株全基因序列分析
埃可病毒7型(Echovirus 7,ECHO7)属于小RNA病毒科人肠道病毒属,常引起儿童病毒性脑炎、手足口病和急性迟缓性麻痹等疾病.为了解病毒性脑炎患者脑脊液中分离获得的一株ECH07毒株(40/Longyou/ZJ)的全基因组特征,进行全基因组测序并分析其分子变异和遗传进化特点.设计引物,提取病毒RNA,PCR扩增和序列测定获得全基因序列.利用Mega4.1、DNAstar、RDP4和SimPlot3.5.1软件分析全基因序列.40/Longyou/ZJ病毒株基因组全长7426个核苷酸(nt),5'端和3'端分别为741nt和100nt的非编码区(Untranslated region,UTR),5'UTR和3'UTR间为一个6585nt长的开放阅读框,编码含2194个氨基酸的多聚蛋白.与GenBank中12株ECHO7代表株的全序列比较发现,核苷酸相似性为79.3％ ～ 85.7％,氨基酸相似性为95.5％ ～ 97.8％.基于5'UTR、P1和P2区构建的遗传进化树中,40/Longyou/ZJ株与ECHO7参考株均在同一进化分支;但在P3区的遗传进化树中却与其他肠道病毒B组病毒聚类.RDP4和SimPlot3.5.1软件分析均证实40/Longyou/ZJ分离株与柯萨奇病毒B组4型(Coxsackievirus B4,CVB4)存在基因自然重组现象,重组位点主要在编码逆转录酶蛋白的3D区.本研究首次对我国脑脊液中分离的ECHO7进行全基因序列测定和分析,发现40/Longyou/ZJ分离株与CVB4存在基因重组,对研究ECHO7的遗传特性具有重要意义.
埃可病毒、全基因组、序列分析、重组
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R373.2+4(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
杭州市农业与社会发展科研计划项目;浙江省公益技术应用项目
2021-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1050-1058
