广州市两株人感染H5N6禽流感病毒全基因组序列特征分析

摘要：

H5N6禽流感是重要的人兽共患病,给公共卫生带来严重威胁.为研究人感染H5N6禽流感病毒的基因特征,本文对广州市两株人感染H5N6禽流感病毒进行全基因组序列扩增,应用生物信息学软件分析分子变异和遗传进化特征.结果 显示:两毒株各基因片段同源性存在差异,血凝素(Hemagglutinin,HA)基因同源性最高为98.3％,PB2基因同源性最低为85.2％.A/Guangzhou/41641/2014 (H5N6)病毒的HA、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)、聚合酶碱性蛋白2(Polymerase basic protein 2,PB2)基因与猫源毒株A/feline/Guangdong/1/2015 (H5N6)亲缘关系较近,推测可能起源于共同祖先.两株病毒均为禽源高致病性病毒,HA和NA表面蛋白受体结合位点、裂解位点和耐药位点未发生变异.内部基因重要位点均有不同程度的变异,其中以41641病毒变异较大,并发生PB2蛋白E627K突变.两株病毒均发生与不同亚型病毒之间的重组现象,41641病毒的内部基因分别与H5和H9N2/H7N9发生重组,其中PB2和PB1基因分别与2013年暴发的华南分支和华东分支H7N9禽流感病毒亲缘关系相近,A/Guangzhou/37845/2015 (H5N6)病毒的内部基因与H5N1/H5N6病毒发生重组.因此,广州市两株人感染H5N6禽流感病毒进化起源不同,属于两种不同的基因型,本研究推测2013年暴发的H7N9禽流感病毒在新型H5N6重组病毒的进化过程中起到重要作用.

关键词：H5N6禽流感、H7N9、基因重组、进化、回顾性研究

所属期刊栏目：36

分类号：R373.1;S852.65(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：广东省自然科学基金;题目:基于基因遗传多态性的禽流感传播风险研究;广州市卫生和计划生育科技项目;题目:广州禽类市场外环境H7N9禽流感变异株监测及其跨宿主传播风险研究;广东省医学科研基金;题目:疫苗选择压力下H7N9禽流感病毒遗传动力学研究;广州市医学重点学科建设项目;题目:病原快速检测实验室;广州市科技计划项目;题目:不同休市策略对活禽市场禽流感病毒净化效果的研究

在线出版日期：2020-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：588-599