10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003630
鼻病毒A21基因型的划分及全基因组特征分析
人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)是导致儿童急性呼吸道感染的主要病毒之一.最近的研究报道发现HRV-A21可导致危重症急性呼吸道感染.本研究将2013～2015年河北省发热呼吸道症候群哨点监测病例中获得的一株HRV-A21病毒标本(本课题组之前的研究已获得VP4/2区序列),结合从GenBank数据库下载的全球98株HRV-A21代表株,基于VP4/2区构建亲缘性关系树.本研究首次将HRV-A21划分为A、B、C、D、E五个基因型,其中E基因型进一步划分为E1、E2和E3亚型,并发现E1、E2和E3亚型在年代分布上呈现出一定的时间进化趋势.我国流行的HRV-A21以C和E基因型为主.基于VP1区划分基因型的结果与VP4/2区相似.本研究进而对这一株HRV-A21进行了全基因组序列测定,并结合GenBank数据库下载的HRV-A21全基因组序列,对HRV-A21进行基因亲缘性关系分析、氨基酸变异和糖基化位点分析.结果 显示VP2区、VP3区、VP1区和3D区都属于高变区,但变异程度VP1区＞VP2区＞VP3区＞3D区,同时发现了保守的14个N-糖基化位点和26个O-糖基化位点,和新增的5个N-糖基化位点和5个O-糖基化位点.本研究在GenBank数据库的基础上结合本课题组获得的一株HRV-A21序列,对HRV-A21进行基因型和基因亚型的划分,对HRV-A21在全球和我国部分地区的分布情况和流行特点进行了初步的分析,并对HRV-A21全基因组序列特征进行了分析,丰富了HRV-A21基因数据库,为HRV-A21诊断、分子流行病学等的研究以及疾病的防控和治疗提供了基础数据.
人鼻病毒A21型(HRV-A21)、基因型、基因特征、全基因组、分子流行病学、糖基化
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R373.1;R511(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
国家科技重大专项;国家科技重大专项;国家科技重大专项;国家科技重大专项
2020-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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